В колониальный период в обращении использовалась индийская рупия, а затем восточноафриканский шиллинг.
В 1951 году введена сейшельская рупия, заменившая восточноафриканский шиллинг по курсу:
1 рупия = 1 шиллинг.

После обретения независимости в 1976 году сейшельская рупия сохранилась как национальная валюта. Деноминаций с изменением масштаба цен не проводилось.
Рупия делится на 100 центов и используется по настоящее время.